LSF作业系统bjob一直pend

生信喵

背景

普通用户A提交bjob任务一直处于pend状态，而之前的用户B则可以成功提交并运行。

插曲

考虑是否用户权限不同

检查两个用户的组id是否一致，将用户A的分组和B一致，排除因组权限不同，导致的任务提交失败。

改了后，仍然无法解决。

最终方案

确定原因是因为新建立的用户A仅在管理节点上存在，而LSF的计算节点不存在该用户，导致提交了任务，而计算节点找不到任务的发起者，所以一直pend。

所以开始同步用户信息给计算的fat节点

1. 使用root登录，远程同步覆盖scp

scp /etc/passwd /etc/shadow /etc/group fat01:/etc/

以上命令，相当于将管理节点的所有用户信息同步给计算节点了。 这样计算节点就可以找到任务的发起者，可以运行了。

2. 以下命令可以查看用户A在计算节点fat01上是否存在。

ssh fat01 id userA

3. 再提交任务，成功运行。

思考

1. 在管理节点建立用户后，需要同步给计算节点，避免这种bug；
2. 找到集群，新增用户的统一规范的命令。