Win10下scoop R安装指南

生信喵

背景

最近用4.4.1的R有时候包装不上，可能rtools啥的编译有问题，试试另一种安装r的方式看看。

操作步骤

安装scoop

首先是在管理员运行Powershell里跑以下两行代码，安装scoop。

Set-ExecutionPolicy RemoteSigned -Scope CurrentUser
iex "& {$(irm get.scoop.sh)} -RunAsAdmin"

安装GNU核心工具

接下来，就可以用scoop来安装各种软件了，又是两行代码，这次安装的是GNU的核心工具，包括bash, make, gawk and grep等等。

scoop bucket add main
scoop install coreutils

安装R

一条指令搞定：

scoop install r

做为R开发者，你还需要点啥 (Optional)

这是可选项，因为R语言很多人只是用户。而做为开发者的话，我们还需要有rtools，和pandoc。latex

用以下指令安装就行：

scoop install rtools

scoop install pandoc
scoop install pandoc-crossref

安装pandoc是编译vignettes时需要。而你编译R包的话，是需要rtools的。

Rstudio配置

Tools-Global options中选择
C:\Users\Administrator\scoop\apps\r\4.5.0\bin\R.exe
然后重启就可以

配置rtools，发现是自动匹配的那就不用弄了。

Sys.which("make")
# "c:\\rtools45\\usr\\bin\\make.exe"

##查看r包安装位置

.libPaths()
# [1] "C:/Users/Administrator/scoop/persist/r/site-library"
# [2] "C:/Users/Administrator/scoop/apps/r/4.5.0/library"  

[1] # 用户级包路径（scoop管理）
[2] # R系统自带包路径
一般不用修改。

建立R包下载目录

安装一开始会先下载包，这些临时文件默认是存储在C盘的某个路径下，C盘不大的话，我建议改动下这个地方。

具体方法就是先建立临时文件存储的路径例如 C:\Users\Administrator\software\R\RStudiowork\R-4.5.0\downloaded_packages

检验rtools是否成功

install.packages("jsonlite", type = "source")

原命令是这个样子，我们需要改动参数

我们执行

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
install.packages("jsonlite", type = "source",destdir = 'C:/Users/Administrator/software/R/RStudiowork/R-4.5.0/downloaded_packages')

安装成功，下载目录也有记录

好了，本次教程到此结束。

后记

使用scoop管理r软件更简单了，不过此次仅试验，因为结合了rstudio去使用，不知道后续有无问题，正常可以直接使用vscode以及bash去使用，不过因为笔者是win10，bash不知道为啥用不起来（win11可以自定义配置文件，从而使用bash终端）。

检查对应的目录中也没有bash.exe.

所以就先这样吧，用起来，出问题再说。