文件搜索

生信喵

一、locate
       locate 命令用于按照名称快速搜索文件所对应的位置，语法格式为“locate 文件名称”。使用 find 命令进行全盘搜索虽然更准确，但是效率有点低。如果仅仅是想找一些常见的且又知道大概名称的文件，不如试试 locate 命令。在使用 locate 命令时，先使用 updatedb 命令（需要 root 权限）生成一个索引库文件，这个库文件的名字是/var/lib/mlocate/mlocate.db，
       后续在使用 locate 命令搜索文件时就是在该库中进行查找操作，速度会快很多。
       第一次使用 locate 命令之前，记得先执行 updatedb 命令来生成索引数据库，然后再进行查找：

1. #更新 locate 数据库
   
2. updatedb
   
3. #显示 locate 数据库
   
4. ls -l /var/lib/mlocate/mlocate.db

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1. #查找文件名
   
2. locate SRX5299464
   
3. #使用正则表达式
   
4. locate -r "samtools[        DISCUZ_CODE_1        ]quot;

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二、whereis 命令
       whereis 命令用于按照名称快速搜索二进制程序（命令）、源代码以及帮助文件所对应的位置，语法格式为“whereis 命令名称”。
       简单来说，whereis 命令也是基于 updatedb 命令所生成的索引库文件进行搜索，它与 locate命令的区别是不关心那些相同名称的文件，仅仅是快速找到对应的命令文件及其帮助文件所在的位置。

1. #whereis 搜索路径
   
2. whereis -l #查找程序文件
   
3. whereis less
   
4. whereis -b less

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三、which 命令
       which 命令用于按照指定名称快速搜索二进制程序（命令）所对应的位置，语法格式为“which命令名称”。
       which 命令是在 PATH 变量所指定的路径中，按照指定条件搜索命令所在的路径。也就是说，如果我们既不关心同名文件（find 与 locate），也不关心命令所对应的源代码和帮助文件（whereis），仅仅是想找到命令本身所在的路径。下面查找一下 locate 和 whereis 命令所对应的路径：

1. #查找软件
   
2. which locate
   
3. 
   
4. #显示全部内容
   
5. whereis locate

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四、find
       find 命令用于按照指定条件来查找文件所对应的位置，语法格式为“find [查找范围] 寻找条件”。当系统中的文件很多时，忘记文件名和文件位置就可以使用 find 命令，find 命令提供了几乎全部条件的检索方式。例如根据文件大小，文件类型，文件日期等。例如想要找到一年之前超过 1G 的文件，然后删除掉，就可以使用 find 命令来完成。

参数	作用
-name	匹配名称
-perm	匹配权限（mode 为完全匹配，-mode 为包含即可）
-user	匹配所有者
-group	匹配所有组
-mtime -n +n	匹配修改内容的时间（-n 指 n 天以内，+n 指 n 天以前）
-atime -n +n	匹配访问文件的时间（-n 指 n 天以内，+n 指 n 天以前）
-ctime -n +n	匹配修改文件权限的时间（-n 指 n 天以内，+n 指 n 天以前）
-nouser	匹配无所有者的文件
-nogroup	匹配无所有组的文件
-newer f1 !f2	匹配比文件 f1 新但比 f2 旧的文件
-type b/d/c/p/l/f	匹配文件类型（后面的字幕字母依次表示块设备、目录、字符设备、管道、链接文件、文本文件）
-size	匹配文件的大小（+50KB 为查找超过 50KB 的文件，而-50KB 为查找小于 50KB 的文件）
-prune	忽略某个目录
-exec …… {}\;	后面可跟用于进一步处理搜索结果的命令（下文会有演示）

       find 命令中的参数以及作用

1. #1 搜索目录下以点 fna 结尾的文件；
   
2. find ~/ -name *.fna
   
3. #2 搜索系统中最近 5 分钟内编辑过的文件；
   
4. find / -amin 5

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      find 中可以根据各种时间选项进行搜索，以”天”为单位：有-atime [+|-]，-mtime，-ctime以“分钟”为单位，包括-amin，-mmin，-cmin 下图中列出了有关时间的一些参数。

1. #3 查找大于100M的文件
   
2. find ./ -size 100M
   
3. 查找到列出来
   
4. find ./ -size 100M -exec ls {} \;
   
5. 查找到直接删除
   
6. find ./ -size 100M -exec rm -rf {} \;
   
7. 
   
8. #4 按照文件类型搜索；
   
9. find  ./ -type d ;文件类型 #c :档案,d: 目录,b: 区块装置档案 ，p: 具名贮列,f: 一般档案,l: 符号连结,s: socket
   
10. 
    
11. #5 查找完进行筛选
    
12. find /share/data/  -name "*.sh" | grep "[0-9]-.*"
    
13. 查找到直接拷贝到当前目录
    
14. find /share/data/  -name "[0-9]*.sh" -xc cp {} ./ \;
    
15. 
    
16. #6 正则表达式筛选
    
17. find ~/ -name "[A-Z]*"        #查以大写字母开头的文件
    
18. find  /etc -name  "host*"     #查以host开头的文件
    
19. find  ~/ -name "[a-z][a-z][0-9][0-9].fa"  #查以两个小写字母和两个数字开头的fa文件
    
20. 
    
21. #7 限制目录层次
    
22. find  ~ -maxdepth 4 -name *.fna   #查时深度最多为4层
    
23. find  ~ -mindepth 3 -name *.fna   #查时深度最少为3层
    
24. 
    
25. #8 搜索文件，直接处理
    
26. find . -type f -exec ls -l {} \; #一定要加分号
    
27. 
    
28. #9 查找并拷贝
    
29. mkdir fna
    
30. find  ~ -maxdepth 3 -name  "*.fna" | xargs -I {}  cp {} ./fna
    
31. 
    
32. #10 查找并删除
    
33. find ./fna -name *.fna
    
34. find ./fna -name *.fna -ok rm '{}' \;
    
35. find ./fna -name *.fna -exec rm '{}' \;
    
36. 
    
37. #搜索当前目录下所有一点fna结尾的文件，然后删除掉。
    
38. find ./fna  -name *.fna | xargs rm

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