Bioconductor

生信喵

一、Bioconductor 项目介绍
Bioconductor 是建立在 R 语言环境上的，用于生物信息数据的注释、处理、分析及可视化工具包的总集，由系列列 R 扩展包组成。很多生物数据都是使用bioconductor 包来分析的。
Bioconductor 官网：

1. http://www.bioconductor.org/

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Bioconductor 项目官网

二、bioconductor 包能做什么？
处理结构化数据，生物数据统计，分析，绘图；
处理 MicroArrays 芯片数据，RNAseq 数据，流式细胞仪数据，定量 PCR 数据，质谱数据等;
基因功能注释，GO，KEGG 等；
生物大数据的数据挖掘，机器学习等；


三、Bioconductor 包不擅长做什么？
非结构化数据处理，例如处理字符串；
很难处理序列匹配，序列拼接，序列比对等工作；
Bioconductor 统计排名：

1. http://bioconductor.org/packages/stats/

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Bioconductor workflows：

1. http://www.bioconductor.org/packages/release/BiocViews.html#___Workflow

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