生信喵 发表于 2024-4-2 13:31:03

氨基酸密码子及逆密码子表

遗传密码又称密码子、遗传密码子、三联体密码,是指信使RNA(mRNA)分子上沿5'端到3'端方向,由起始密码子AUG开始,每三个核苷酸组成的三联体。它决定肽链上每一个氨基酸和各氨基酸的合成顺序,以及蛋白质合成的起始、延伸和终止。首个密码子是由美国科学家尼伦伯格于1961年完成。尼伦伯格在无细胞系统环境下,将一条只由尿嘧啶组成的RNA体外翻译成一条只有苯丙氨酸(Phe)组成的多肽,由此破译了首个密码子(UUU -> Phe),随后科学家科拉纳破译了其余的密码子。

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下表列举了标准的密码子表,包含了64种密码子及其配对的氨基酸。

# 密码子表

|            |   | 第二位碱基                | 第二位碱基      | 第二位碱基          | 第二位碱基          |
| ---------- | - | ------------------------- | ----------------- | ------------------- | ------------------- |
|            |   | U                         | C               | A                   | G                   |
| 第一位碱基 | U | UUU (Phe/F)苯丙氨酸       | UCU (Ser/S)丝氨酸 | UAU (Tyr/Y)酪氨酸   | UGU (Cys/C)半胱氨酸 |
| 第一位碱基 | U | UUC (Phe/F)苯丙氨酸       | UCC (Ser/S)丝氨酸 | UAC (Tyr/Y)酪氨酸   | UGC (Cys/C)半胱氨酸 |
| 第一位碱基 | U | UUA (Leu/L)亮氨酸         | UCA (Ser/S)丝氨酸 | UAA (终止)          | UGA (终止)          |
| 第一位碱基 | U | UUG (Leu/L)亮氨酸         | UCG (Ser/S)丝氨酸 | UAG (终止)          | UGG (Trp/W)色氨酸   |
|            |   |                           |                   |                     |                     |
| 第一位碱基 | C | CUU (Leu/L)亮氨酸         | CCU (Pro/P)脯氨酸 | CAU (His/H)组氨酸   | CGU (Arg/R)精氨酸   |
| 第一位碱基 | C | CUC (Leu/L)亮氨酸         | CCC (Pro/P)脯氨酸 | CAC (His/H)组氨酸   | CGC (Arg/R)精氨酸   |
| 第一位碱基 | C | CUA (Leu/L)亮氨酸         | CCA (Pro/P)脯氨酸 | CAA (Gln/Q)谷氨酰胺 | CGA (Arg/R)精氨酸   |
| 第一位碱基 | C | CUG (Leu/L)亮氨酸         | CCG (Pro/P)脯氨酸 | CAG (Gln/Q)谷氨酰胺 | CGG (Arg/R)精氨酸   |
|            |   |                           |                   |                     |                     |
| 第一位碱基 | A | AUU (Ile/I)异亮氨酸       | ACU (Thr/T)苏氨酸 | AAU (Asn/N)天冬酰胺 | AGU (Ser/S)丝氨酸   |
| 第一位碱基 | A | AUC (Ile/I)异亮氨酸       | ACC (Thr/T)苏氨酸 | AAC (Asn/N)天冬酰胺 | AGC (Ser/S)丝氨酸   |
| 第一位碱基 | A | AUA (Ile/I)异亮氨酸       | ACA (Thr/T)苏氨酸 | AAA (Lys/K)赖氨酸   | AGA (Arg/R)精氨酸   |
| 第一位碱基 | A | AUG (Met/M)甲硫氨酸(起始) | ACG (Thr/T)苏氨酸 | AAG (Lys/K)赖氨酸   | AGG (Arg/R)精氨酸   |
|            |   |                           |                   |                     |                     |
| 第一位碱基 | G | GUU (Val/V)缬氨酸         | GCU (Ala/A)丙氨酸 | GAU (Asp/D)天冬氨酸 | GGU (Gly/G)甘氨酸   |
| 第一位碱基 | G | GUC (Val/V)缬氨酸         | GCC (Ala/A)丙氨酸 | GAC (Asp/D)天冬氨酸 | GGC (Gly/G)甘氨酸   |
| 第一位碱基 | G | GUA (Val/V)缬氨酸         | GCA (Ala/A)丙氨酸 | GAA (Glu/E)谷氨酸   | GGA (Gly/G)甘氨酸   |
| 第一位碱基 | G | GUG (Val/V)缬氨酸         | GCG (Ala/A)丙氨酸 | GAG (Glu/E)谷氨酸   | GGG (Gly/G)甘氨酸   |

为了方便查询,下表列举了每个氨基酸的逆密码子表,方便快速定位某个氨基酸对应的密码子

# 逆密码子表

| 中文名称   | 英文名称      | 三字母缩写 | 单字母缩写 | 密码子                  |
| ---------- | ------------- | ---------- | ---------- | ----------------------- |
| 丙氨酸   | Alanine       | Ala      | A          | GCU,GCC,GCA,GCG         |
| 精氨酸   | Arginine      | Arg      | R          | CGU,CGC,CGA,CGG,AGA,AGG |
| 天冬酰胺   | Asparagine    | Asn      | N          | AAU,AAC               |
| 天冬氨酸   | Asparticacid| Asp      | D          | GAU,GAC               |
| 半胱氨酸   | Cystine       | Cys      | C          | UGU,UGC               |
| 谷氨酸   | Glutamicacid| Glu      | E          | GAA,GAG               |
| 谷氨酰胺   | Glutarnine    | Gln      | Q          | CAA,CAG               |
| 甘氨酸   | Glycine       | Gly      | G          | GGU,GGC,GGA,GGG         |
| 组氨酸   | Histidine   | His      | H          | CAU,CAC               |
| 异亮氨酸   | Isoleucine    | Ile      | I          | AUU,AUC,AUA             |
| 亮氨酸   | Leucine       | Leu      | L          | UUA,UUG,CUU,CUC,CUA,CUG |
| 赖氨酸   | Lysine      | Lys      | K          | AAA,AAG               |
| 蛋氨酸   | Methionine    | Met      | M          | AUG                     |
| 苯丙氨酸   | Phenylalanine | Phe      | F          | UUU,UUC               |
| 脯氨酸   | Proline       | Pro      | P          | CCU,CCC,CCA,CCG         |
| 丝氨酸   | Serine      | Ser      | S          | UCU,UCC,UCA,UCG,AGU,AGC |
| 苏氨酸   | Threonine   | Thr      | T          | ACU,ACC,ACA,ACG         |
| 色氨酸   | Tryptophan    | Trp      | W          | UGG                     |
| 酪氨酸   | Tyrosine      | Tyr      | Y          | UAU,UAC               |
| 缬氨酸   | Valine      | Val      | V          | GUU,GUC,GUA,GUG         |
| 起始密码子 |               |            |            | AUG                     |
| 终止密码子 |               |            |            | UAG,UGA,UAA             |

下面的圆盘图更直观地展示的密码子的分布图
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